Круглі черви мають первинну порожнину тіла – псевдоціль, яка заповнена рідиною. У ній розташовані всі внутрішні органи. Вони утворюють п’ять диференційованих систем – травну, видільну, нервову, статеву та м’язову. Кровоносна та дихальна системи відсутні.
Статева система: у самок – парні яєчники, яйцепроводи, матка і статевий отвір на черевному боці; у самців – непарний ниткоподібний сім’яник і сім’явідвідник, що впадає в задню кишку перед самим анальним отвором, а також складний копулятивний апарат.
У представників Типу Круглі черв’яки нервова система представлена навкологлотковим нервовим кільцем і шістьма поздовжніми стовбурами (сходового типу), що відходять від нього. Два більші стовбури – черевний і спинний – з’єднані півкільцевими перемичками.