Проведення в лабораторії ПЛР-аналізу відбувається в три етапи: (1) виділення ДНК; (2) ампліфікація ДНК-фрагментів; (3) детекція ДНК-продуктів ампліфікації.
ПЛР-аналіз ДНК у лабораторії включає три етапи: виділення; ампліфікація фрагментів; детекція продуктів амплікації.
Зазвичай під час проведення ПЛР виконується 20-35 циклів, кожен з яких складається з трьох стадій. Дволанцюгову ДНК-матрицю нагрівають до 94-96°C (або до 98°C, якщо використовується особливо термостабільна полімераза) на 0,5-2 хвилини, щоб ланцюги ДНК розійшлися.
Денатурація Дволанцюгову ДНК-матрицю нагрівають до 94-96 °C (або до 98 °C, якщо використовується особливо термостабільна полімераза) на 0,5-2 хвилини, щоб ланцюги ДНК розійшлися. Ця стадія називається плавленням (денатурацією), оскільки руйнуються водневі зв’язки між двома ланцюгами ДНК.