Функції контролю і нагляду за діяльністю недержавних пенсійних фондів виконує Міністерство охорони здоров’я та соціального розвитку РФ і ФСФР Росії в рамках своїх повноважень.
Функціонування НПФ у РФ регулюється Федеральним законом від 07.05.1998 N 75-ФЗ “Про недержавні пенсійні фонди” (актуальна його редакція від 03.08.2018).
Банк Росії є одночасно регулятором і контролюючим органом для керуючих компаній інвестиційних фондів, НПФ та інвестиційних фондів: він встановлює правила на ринку колективних інвестицій і стежить за їх дотриманням.
Координацію діяльності Пенсійного фонду Російської Федерації здійснює Міністерство праці та соціального захисту Російської Федерації. Пенсійний фонд виконує низку соціально значущих функцій: Облік прав громадян з обов’язкового пенсійного страхування, державного пенсійного та соціального забезпечення.