Водень може використовуватися як паливо у звичайному двигуні внутрішнього згоряння. У цьому випадку знижується потужність двигуна до 65% – 82% порівняно з бензиновим варіантом.
Виробництво водню не екологічне Автомобілі на водневих паливних елементах позиціонуються як екологічно чисті, оскільки викиду шкідливих речовин немає, і під час перетворення водню в енергію утворюється лише один побічний продукт – вода.
З паливних елементів витягується електрична енергія. Однак є низка проблем. Наприклад, під час використання паливних елементів у літальному апараті на висоті понад дев’ять кілометрів виникатиме несприятливий вплив води. При спалюванні водню з’являються оксиди азоту.
Перевага водню порівняно з вуглеводнями полягає в тому, що при його використанні не відбувається викидів CO2 та інших шкідливих речовин.